Dalam permainan, pemain dapat memilih berbagai macam gadis cantik, terus-menerus mengembangkan mereka untuk melancarkan pertempuran strategi tembak-menembak. Dipercaya bahwa pemula akan tertarik dengan karakter yang hidup, pengembangan karakter, dan mekanisme kartu tembak-menembak, lalu mulai penasaran dengan cerita baru dari Goddess of Victory. Jadi, berikut ini adalah bagian dari latar belakang cerita permainan, untuk membantu pemula memahami, meningkatkan pengalaman bermain dan keterlibatan.

Permainan ini mengatur latar di dunia fiksi ilmiah pasca-apokaliptik, di mana manusia diserang oleh mekanik misterius bernama Racter, yang membuat rumah mereka di permukaan bumi runtuh. Dalam serangan ini, manusia yang selamat dipaksa untuk melarikan diri ke kota-kota bawah tanah yang disebut Ark.

Untuk merebut kembali Ark di permukaan, pemerintah bergabung dengan tiga perusahaan besar, Elysion, Missilith, dan Tetra, mengembangkan senjata humanoid bernama "Nikke". Mereka adalah cyborg hasil gabungan teknologi mekanikal dan biologis, memiliki kekuatan tempur yang kuat sekaligus patuh mutlak terhadap perintah manusia.

Namun, Nikkes juga dilihat sebagai alat oleh masyarakat, bukan entitas yang setara. Pemain akan berperan sebagai komandan, memimpin tim Nikke, kembali ke permukaan, menghadapi ancaman menakutkan dari Racter, berjuang melawan kekuatan invasi asing di dunia pasca-apokaliptik, membantu orang-orang merebut kembali tanah asli mereka.

Pada awal permainan, disajikan sebuah realitas yang kejam: Nikke "Marian", seorang rekan penjaga, karena terinfeksi virus dan diserang oleh Racter, akhirnya mengkhianati pemain, sehingga harus dieksekusi sendiri. Bagian ini mengindikasikan bahwa musuh telah meresap ke dalam Ark, dan mungkin juga akan menjadi petunjuk untuk plot selanjutnya.

Itulah sinopsis cerita baru dari Goddess of Victory, latar belakang dan cerita pendahuluan berpusat pada konflik antara manusia dan mesin, pencerahan kesadaran diri Nikke, serta konflik internal di dalam Ark. Tidak hanya pertempuran di dunia pasca-apokaliptik, tetapi juga perjuangan manusia, sangat direkomendasikan bagi para pemain untuk mencoba dan mengalami cerita selanjutnya secara langsung.